وكان البابا يشتهى أن يجدد العلاقه بين الكنيسه القبطيه والكنيسه الآنطاكيه ولكنه لم يجد يوما هادئا يستطيع فيه أن يكتب رساله شركه اليهم ولكنه لم يكن يستطيع أن يحقق ما كان يصبوا إليه0 وكان الخليفه المأمون قد أتى إلى مصر ليقمع ثوره الأقباط 0 فأعطى البابا يوساب خطابا فيه أمرا بإقراره رئيسا عاما روحيا على الأمه القبطيه ، وعلى جميع الكنائس القبطيه فى مصر ومن يخدمون فيها من كهنه وأراخنه وكتب له أيضا الخليفه المعتصم خطابا مثله عندما تولى الحكم بعد أخيه0
العلاقه بين المعتصم وملك النوبه: ويقول القس منسى يوحنا ص352 أن الحرب بين ملوك الحبشه وولاه مصر إستمرت14 سنه إلى أن تولى ابراهيم أخو المأمون الخلافه ( المعروف بالخليفه المعتصم) وأرسل الخليفه المعتصم وأقام حراسا على الطرق التى بين مصر وبين النوبه والحبشه حاول البابا يوساب رأب الصدع بين الخليفه العباسى المعتصم وملك النوبه ، فقد بدأت العلاقات بينهم بالتوتر حينما أرسل الخليفه خطابا الى زكريا ملك النوبه يطالبه فيه بالخراج المتأخر عليه لمده 14 سنه وإلا سيرفع عليه السيف ، وكان مندوب الخليفه قد وصل الى مصر وكان لوالى مصر كاتبا مسيحيا بالصعيد إسمه جرجس فقام البابا يوساب بإرسال رساله الى ملك النوبه حملها جرجس الى ملك النوبه قال له فيها: " إن الخليفه المعتصم يبدى الموده للمسيحيين ، فيحسن بك أن تلبى ندائه ما إستطعت الى ذلك سبيلا 0" وحمل الرسالتان مندوبان شخصيان من كل منهما { راجع أيريس حبيب المصرى ج2 ص430 } وأرسل خطابا الى ملوك الحبشه يعرفهم فيه أنه إنقطع عن الكتابه إليهم بسبب ما حل على الأقباط من إضطهاد ونصحهم بتجنب الخلاف مع المسلمين0 ووصل الخطابين الى ملك النوبه فذهب إبنه جرجس بهدايا جزيله الى مصر وقابل الولاه والبابا القبطى الذى قابله بفرح عظيم وودعه عند ذهابه ليقابل الخليفه المعتصم فى بغداد فتلقاه المعتصم بإكرام ولغى الخليفه كل الخراج المستحقه لمده 14 سنه ثم أعطاه ذهبا وفضه كهدايا مع ملابس وأمر ان تصاحبه الجنود لكى يوصلوه بسلام الى بلاده 0وعندما وصل الى مصر فى طريق العوده الى بلاده أعطاه البابا القبطى هديه عباره عن هيكلا مكرزا معمول بطريقه فنيه تدل على تقدم الأقباط فى فن النجاره فقد كان الهيكل مصمما بحيث يمكن فكه الى قطع وتركيبه حسب الحاجه فوضعوا الهيكل فى بيت ملك النوبه ووضعوا جرسا على سقف البيت وكان الأساقفه عندما يقيمون الصلاه فى بيته يضربون الناقوس فى وقت القداس تماما كما يحدث فى الكنائس فتعجب الجميع لإنه لم يحدث هذا من قبل0